La sanificazione è un intervento mirato all'eliminazione di qualsiasi batterio e agente contaminante che, con le comuni pulizie, non si riesce a rimuovere. La Illiria procede alla sanificazione avvalendosi di prodotti chimici detergenti secondo le linee guida europee e internazionali, in tal modo è in grado di riportare il carico microbico entro standard di igiene accettabili e ottimali che dipendono dalla destinazione d'uso degli ambienti interessati (temperatura, ventilazione, umidità, presenza di polveri, etc.). Anche in questo caso, prima di procedere all'intervento in loco, risulta necessario effettuare un sopralluogo, al termine del quale si concorderanno, con la clientela, gli interventi necessari.